Professor J. Werder-Stiftung zeichnet Persönlichkeiten aus, die sich in den Bereichen Lebensmittelqualität und -sicherheit, insbesondere der Lebensmittelchemie, verdient gemacht haben. Die Stiftung verleiht die Werder‑Medaille und den Werder‑Preis mit begleitender Urkunde; die Auszeichnung erfolgt in der Regel alle zwei Jahre.