Die Kernaktivität des Unternehmens Pro Natura Aargau ist der Naturschutz, insbesondere die Erhaltung und Förderung der Biodiversität, der Landschaft und der natürlichen Ressourcen im Kanton Aargau. Dazu gehören die Betreibung von Naturzentren, die Durchführung von Projekten und Veranstaltungen, die Förderung von Umweltschutz und die Sensibilisierung der Öffentlichkeit für natur- und umweltschutzrelevante Themen.