Theo Nydegger Stiftung unterstützt alleinerziehende oder bedürftige Eltern mit Kindern bis zum 18. Lebensjahr, bedürftige Kinder bis zum 18. Lebensjahr sowie steuerbefreite Institutionen (z. B. Kinderbetreuung, Schulen, Sport‑ und Kulturvereine) und Tierheime durch finanzielle Zuwendungen und Projektförderungen. Die Stiftung verfolgt gemeinnützige Zwecke und ist politisch wie konfessionell neutral.